江蘇省南通農墾事業管理辦公室于1997年9月設立，位于南通市青年西路85號，是江蘇省農墾事業管理辦公室所屬的非獨立事業法人機構。主要職能是：墾地關系協調、存量資產管理、老干部服務和原下屬企業遺留問題清理處理。

截止2025年底，南通農墾事業辦在職人員2人。事業辦共有房屋資產800多平方米，除部分房屋自用外，剩余部分對外出租。

近年來，南通農墾事業辦主要工作內容有：一是做好離退休人員服務管理工作，認真落實老同志的各項政策和待遇，住院看望、重大節日走訪慰問。二是認真完成集團公司交辦的其他工作，做好農場與地方政府部門的溝通協調工作。三是處理好改制企業的一系列遺留問題：協助原改制企業職工辦理退休手續，保障改制企業傷殘人員的基本生活費及住院醫療補助等，做好穩定工作。